Welkom in een nieuwe wereld van Danganronpa en bereid jezelfd voor op de grootste en spannendste episode tot nu toe. De game speelt zich af in een "psycho-coole" omgeving waar een cast van 16 nieuwe karakters word gekidnapt en opgesloten in een school. Binnen zullen sommigen doden, sommigen zullen sterven en sommigen zullen gestraft worden. Her-evalueer wat je dacht dat een onderzoek in Danganronpa was en ga op zoek naar aanwijzingen naar een aantal moordzaken terwijl je je nieuwe vrienden ter dood veroordeeld.